NieR:Automata Ver1.1a

Pada tahun 5012 Masehi, tiba-tiba alien datang ke Bumi bersama makhluk ciptaan mereka, mesin-mesin hidup, yang membuat umat manusia berada di ambang kepunahan. Segelintir manusia yang berhasil melarikan diri ke bulan mulai melancarkan operasi balasan untuk merebut kembali Bumi dengan menggunakan tentara android. Namun, di hadapan mesin-mesin hidup yang terus berkembang biak tanpa henti, pertempuran tersebut mengalami kebuntuan. Sebagai senjata pemungkas, umat manusia mengirim pasukan android baru yang disebut "YoRHa" ke Bumi. Pada tahun 11945 Masehi, "Operasi Pendaratan ke-243" dilancarkan, dan anggota baru pasukan YoRHa, 2B dan 9S, dikirim ke Bumi. Keduanya berhasil mengalahkan unit inti mesin hidup, Adam dan Eve. Menganggap ini sebagai kesempatan untuk memusnahkan musuh dan mengakhiri perang yang berkepanjangan, umat manusia memutuskan untuk melancarkan serangan besar-besaran terhadap mesin-mesin hidup. Ini adalah catatan tentang perjuangan dan harapan para android yang dipermainkan oleh takdir.