Buddy Daddies Menceritakan Tentang: Pembunuh Kazuki Kurusu dan Rei Suwa bertemu Miri, seorang gadis yang mencari ayahnya di Hari Natal. Kazuki, Rei, dan Miri tiba-tiba akhirnya tinggal bersama. Mengikuti Kazuki Kurusu, seorang kontraktor / koordinator kriminal yang tinggal bersama sahabatnya, Rei Suwa, seorang pembunuh profesional yang dibesarkan sejak kecil untuk menjadi seorang pembunuh kontrak. Kazuki adalah orang yang ramah dan suka berjudi dan wanita, sedangkan Rei adalah pria yang tidak banyak bicara yang menghabiskan waktunya bermain video game. Suatu hari, kedua sahabat itu akhirnya merawat Miri Unasaka, seorang gadis berusia empat tahun yang ayahnya adalah seorang bos mafia, setelah Miri secara tidak sengaja berkeliaran dalam baku tembak di sebuah hotel sambil mencari ayahnya.