Seorang anak laki-laki, Gon menemukan bahwa ayahnya, yang meninggalkannya di usia muda, sebenarnya adalah seorang Hunter yang terkenal di dunia, seorang profesional berlisensi yang mengkhususkan diri dalam pengejaran fantastis seperti menemukan spesies hewan langka atau tak dikenal, berburu harta karun, menyurvei daerah kantong yang belum dijelajahi, atau memburu individu yang melanggar hukum. Gon berangkat dalam perjalanan untuk menjadi seorang Hunter dan akhirnya menemukan ayahnya. Sepanjang perjalanan, Gon bertemu dengan berbagai Hunter lainnya dan menghadapi hal-hal